Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms