Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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