Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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