Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCAPQ12770 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCAPQ12770 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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