Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms