Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF85Q03923 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms