Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARDQ03181 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms