Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ID3Q02535 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ID3Q02535 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms