Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms