Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHDQ02161 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RHDQ02161 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RHDQ02161 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHDQ02161 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHDQ02161 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms