Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms