Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL20P78556 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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