Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms