Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms