Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CABP4P57796 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABP4P57796 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms