Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms