Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms