Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms