Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1P51787 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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