Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSFMP43897 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSFMP43897 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSFMP43897 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSFMP43897 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms