Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPOP42166 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms