Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms