Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms