Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRBP28702 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRBP28702 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRBP28702 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRBP28702 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRBP28702 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRBP28702 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RXRBP28702 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RXRBP28702 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRBP28702 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRBP28702 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRBP28702 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRBP28702 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms