Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX2P28328 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms