Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO1P25800 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO1P25800 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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