Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms