Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASA1P20936 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASA1P20936 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASA1P20936 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA1P20936 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RASA1P20936 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASA1P20936 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASA1P20936 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASA1P20936 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RASA1P20936 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA1P20936 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA1P20936 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA1P20936 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA1P20936 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA1P20936 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms