Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms