Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms