Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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