Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms