Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms