Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIL1P09327 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIL1P09327 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms