Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB1P08034 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB1P08034 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms