Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA2P02652 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA2P02652 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA2P02652 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA2P02652 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA2P02652 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA2P02652 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA2P02652 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA2P02652 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA2P02652 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms