Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms