Protein–RNA interactions for Protein: O76075

DFFB, DNA fragmentation factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFBO76075 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DFFBO76075 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DFFBO76075 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DFFBO76075 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DFFBO76075 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms