Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms