Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms