Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNSO60931 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNSO60931 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNSO60931 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms