Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF3O43395 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms