Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms