Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms