Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms