Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC78A2IDD5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms