Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTBP13-201ENST00000423971 3959 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP304-201ENST00000411199 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161447.1-201ENST00000427811 230 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 THBS3-211ENST00000541990 2928 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms