Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms