Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms