Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms